Berawal dari sebuah Pengajian BTQ (Baca Tulis Al-Qur`an ) di Musholla At-tawakkal di desa Karangsuwung Pimpinan K. M.Soleh,berdirilah Madrasah Ibtidaiyah (MI) dengan nama MIFTAHUL ATHFAL pada tahun 1977 yang kemudian diganti dengan nama MI AL-IKHLAS.
Kemudian tahun berikutnya tepatnya tanggal 16 Juli 1979 berdirilah MTs Al-Ikhlas dengan para pendiri KM. SALEH, K.H.Abdul Hamid, K. Anwaruddin,M.Aridli dan para tokoh ulama Kecamatan Karangsembung yang ditunjuk sebagai kepala sekolahnya Drs.HASANUDDIN SALEH yang dibantu oleh personal Guru :
1. Drs. Atang Hanafi (Wakil Kepala)
2. K.H. Abdul Hamid
3. K.Anwaruddin
4. Idmal Ladjuantara
5. Hasan Hariri
6. Didin F.
7. Dadang Iskandar
8. Wahid
9. Asnawi
10. Uun Kustinah
11. Achmad Faelani, tata Usaha
keadaan murid awal tahun sebanyak 32 siswa, yang belajar dan menempati gedung MI Al-Ikhlas desa karangsuwung yang sekarang menjadi DTA Al-Ikhlas Karangsuwung.
Pada tahun 1982, MTs Al-Ikhlas bertambah nama menjadi MTs Al-IKHLAS GUPPI (Gabungan Usaha Pembaharuan Pendidikan Islam ).
Tahun 1985 MTs AL-IKHLAS GUPPI mendapat bantuan gedung di lokasi yang sedang ditempati.
Tahun 1995, berdasarkan SK, Menteri Agama RI, nomor :515 A/1995 tanggal 25 November 1995, MTs AL-IKHLAS GUPPI dinegerikan dan namanya dirubah menjadi MTs Negeri Karangsembung dan diangkat sebagai kepalanya Drs.HASANUDDIN SALEH .
Perkembangan sarana Prasarana MTs dari tahun ketahun membuktikan perkembangannya, dengan dibuktikan Bangunan bertingkat, sampai sekarang Al-Hamdulillah MTs Negeri Karangsembung yang pada tahun 2017 mengalami perubahan menjadi MTs Negeri 6 Cirebon, secara keseluruhan menunjukan perkembangannya dengan jumlah Rombel 28 kelas saat ini.
PROFIL KEPALA MADRASAH
- Drs.Hasanuddin Saleh (1979 – 2005)
- Drs.H.IKIN SODIKIN (2005 – 2008)
- Drs.E. ANURI HIDAYAT (2008 – 2009)
- Drs.H.ABU HANIFAH CH,BAE,M.Pd. (2009 – 2012)
- Drs.H.ABU BAKAR M.A (2012 – 2015)
- Drs.H.ABDUL GHOFAR (2015 – 2016)
- Drs.H.ALI SIDDIQ, MM (2016 – 2017)
- Drs.H.ROKHMAT,M.A (2017 – 2021)
- H. Soif, S.Ag., M.Pd (2022 – sekarang)
